『古事記』には神産巣日神、『日本書紀』には神皇産霊尊（かみむすびのみこと）と記されている。また高御産巣日神が、高木神等の別名を持つように神産巣日神にも神魂神（かみむすびのかみ）、神産巣日御祖命（かみむすひのみおやのみこと）などの別名を持っている。
高皇産霊神と対立的存在として出現する神で、ものが生まれるということから男女、雄雌の両性が想像できる。一般的には高御産巣日神が男神、神産巣日神が女神とされている。
『中臣寿詞（なかとみのよごと）』等には高天原に鎮まる天津神、皇親神留伎命（すめむつかむろきのみこと）、皇親神留弥命（すめむつかむろみのみこと）であるとする記載などが存在することからもこの二柱の神が一対であることを感じさせる。
天之御中主神、高御産巣日神と共に「造化三神」と称れるが、天之御中主神に対して、高御産巣日神と神産巣日神の二柱の神は天地根元神の活動面を表す神で、荒魂（あらみたま）、和魂（にぎみたま）に関係があるとする説もある。
また、この後に現れる宇摩志阿斬訶備比古遅神、天之常立神を加えて「別天津神（ことあまつかみ）」とも称される。
『古事記』には、大国主神を兄弟の八十神達が、猪に似た大石を火で焼いて転がし落とし大国主神を殺してしまったとき、「御母神が泣き悲しんで高天原に上がって、神産巣日命に救いを請うたとき、ただちに蚶貝比売と蛤貝比売とを遣わして治療して蘇生させられた。」とあり、神産巣日神が大国主神の蘇生を命じている。
また大国主神と少名毘古名神の「国作り神話」でも、神産巣日神は大国主神に少名毘古名神が本当に自分の子かと問われたときに、「これは本当に私の子です。子供の中で、私の手の指の間から漏れた子です。そしてお前は葦原色許男命（大国主神の異称）と兄弟になって、その国を作り固めなさい。」と答えている。
これらの事から、高御産巣日神が高天原系の神話で諸神に命じる立場で書かれているのと同様、出雲系の神話において指導的立場で書かれているのが見て取れる。
ちなみに、平安時代初期に編纂された『新撰姓氏禄（しんせんしょうじろく）』によれば、神産巣日神を祖先とする一族には賀茂県主（かものあがたぬし）、紀直（きのあたい）、竹田連（たけだのむらじ）等がいる。